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• Les équipements  d’imagerie

• Trois IVIS spectrum (ISP/PFIE; VIM/IERP; UMR ASTRE) en confinement A2 pour imager des petits animaux. Ces équipements sont adaptés au petit animal vivant anesthésié (rongeurs, volailles) pour la détection détection « corps entier » ;
• Imagerie Biphotonique  pour l’observation in vivo de zebrafish. Le plateau de phénotypage (IERP/VIM) propose des services liés à l’utilisation du poisson zèbre comme modèle in vivo pour l’étude de pathologies infectieuses et inflammatoires notamment par des approches d’imagerie dynamique. Le plateau de phénotypage possède aussi deux postes de micro-injections (situés en laboratoire conventionnel et en laboratoire confiné A2) au sein d’une zone BSL2 ;
• Cellvizio Dual Band® (PFIE/CIMAC) : système d'imagerie in vivo, par fibre (endomicroscopie confocale), qui permet d'accéder aux tissus en profondeur et d'atteindre une résolution cellulaire, depuis la surface jusqu'au plus profond du tissu (poumons, système reproducteur, digestif, respiratoire, nerveux, sanguins) pour le petit et le gros animal ;
• Fluobeam® (PFIE/CIMAC) : système d'imagerie in vivo de surface (caméra) ou pré-opératoire (ganglion, peau), par fluorescence, pour le petit et le gros animal ;
• Echographe (PFIE/CIMAC) : pose de cathéter ou ponction écho-guidée ;
• Endo-fibroscope (PFIE/CIMAC) : Ex. Inoculation et Lavage Broncho-Alvéolaire sur bovins, porc, blaireaux.

• Equipements disponibles chez nos partenaires

• Le service d’imagerie in vivo de la plate-forme CIRE est sur le même site que la PFIE (Centre INRAE Val de Loire) est dédié aux grands animaux : ovins, caprins et porcins etc.  Il est équipé d'appareils d’imagerie de dernière génération initialement conçus pour la clinique humaine (IRM 3 Tesla, CT scan, scanner X, échographe Dopler, endomicroscope confocal laser).
  Cet ensemble d’outils d’imagerie performants permet : d’obtenir des images anatomiques et fonctionnelles sur des animaux de grande taille avec une vision en trois dimensions (3D) sans altérer leur intégrité physique ; de mettre au point des modèles animaux proches de la clinique humaine ; de réaliser des analyses sériées sur animaux vivants avec un suivi temporel permettant d’en limiter le nombre. Une analyse de tissus animaux infectés est possible dans des conditions particulières. Une collaboration PFIE/CIRE a par exemple permis d’imager des poumons de blaireaux au CT scan dans le cadre d’une étude d’un vaccin contre la tuberculose ;
• Cytométrie en flux 8 couleurs (UMR ISP, UR VIM, UMR ASTRE) ;
• Imagerie confocale et feuillet de lumière, en partenariat avec les UMR ISP; VIM, ASTRE, …

• Les services disponibles au sein d'Emerg'in et chez nos partenaires

• Imagerie optique adaptée à la détection in-vivo de fluorescence  et de bioluminescence avec une analyse tomographique et reconstruction 3D ;
• Imagerie par ultrasons ;
• Imagerie optique fibrée ;
• Microscopie confocale en partenariat avec l’UMR ISP, des analyses en cytométrie sont aussi possibles avec nos partenaires dans les UMR ISP, VIM, ASTRE ;
• Des services d’histologie avec une expertise en histopathologie animale et en en phénotypage tissulaire unique en France en partenariat avec la plate-forme APEX et l’UMR ISP (PF Imagerie et Infectiologie). Transparisation d’organes et immunomarquages.

• Les dispositifs

• Plate-Forme d'Infectiologie Expérimentale (PFIE)
• Plate-forme d’infectiologie Expérimentale des Rongeurs et des poissons (IERP) 
• APEX : Expertise en anatomie pathologique pour la recherche (partenaire)
• UMR ISP, Laboratoire d'imagerie et infectiologie (partenaire)
• PIXANIM : Phénotypage par Imagerie in/eX vivo de l’ANImal à la Molécule (partenaire)
• Plate-forme Microscopie et Imagerie des Micro-organismes Animaux et Aliments MIMA-2 (partenaire)